Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CYI0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CYI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CYI0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CYI0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CYI0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CYI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms