Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem39aQ9CYC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem39aQ9CYC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem39aQ9CYC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms