Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr1Q9CY50 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr1Q9CY50 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssr1Q9CY50 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms