Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrps28Q9CY16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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