Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpusd4Q9CWX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpusd4Q9CWX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms