Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd12Q9CWU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms