Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NubplQ9CWD8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NubplQ9CWD8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NubplQ9CWD8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms