Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smurf1Q9CUN6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms