Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms