Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snw1Q9CSN1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms