Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard3bQ9CSB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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