Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exosc5Q9CRA8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc5Q9CRA8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms