Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msmo1Q9CRA4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msmo1Q9CRA4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms