Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NmbQ9CR53 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms