Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Klhl28Q9CR40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl28Q9CR40 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms