Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec61bQ9CQS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec61bQ9CQS8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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