Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PsenenQ9CQR7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PsenenQ9CQR7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms