Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndufb9Q9CQJ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms