Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmed6Q9CQG0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms