Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Asf1aQ9CQE6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Asf1aQ9CQE6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms