Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.4 ms