Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc5Q9CQA1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc5Q9CQA1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms