Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CQ90 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQ90 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQ90 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms