Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ubl4bQ9CQ84 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ubl4bQ9CQ84 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ubl4bQ9CQ84 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ubl4bQ9CQ84 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ubl4bQ9CQ84 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ubl4bQ9CQ84 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ubl4bQ9CQ84 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ubl4bQ9CQ84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms