Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nudcd2Q9CQ48 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd2Q9CQ48 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms