Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NenfQ9CQ45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NenfQ9CQ45 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms