Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl17Q9CPR4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl17Q9CPR4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl17Q9CPR4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl17Q9CPR4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl17Q9CPR4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl17Q9CPR4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl17Q9CPR4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms