Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Bap1Q99PU7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bap1Q99PU7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Bap1Q99PU7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms