Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2a1Q99PM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a1Q99PM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms