Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc4Q99PH1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc4Q99PH1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms