Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RetnQ99P87 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RetnQ99P87 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetnQ99P87 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms