Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acss1Q99NB1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acss1Q99NB1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acss1Q99NB1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms