Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a6cQ99N08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms