Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4dQ99N05 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms