Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CalcbQ99MP3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CalcbQ99MP3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms