Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PccbQ99MN9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PccbQ99MN9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms