Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkd1Q99MH6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkd1Q99MH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkd1Q99MH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms