Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epdr1Q99M71 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Epdr1Q99M71 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms