Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd3Q99LY2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gdpd3Q99LY2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gdpd3Q99LY2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms