Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp16Q99LG0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp16Q99LG0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms