Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99KU6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99KU6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99KU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99KU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99KU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99KU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99KU6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99KU6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99KU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99KU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99KU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99KU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99KU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99KU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99KU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99KU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99KU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99KU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99KU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99KU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99KU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99KU6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q99KU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q99KU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q99KU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q99KU6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q99KU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q99KU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q99KU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q99KU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q99KU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q99KU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q99KU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Q99KU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q99KU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q99KU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q99KU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms