Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmed9Q99KF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms