Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp11Q99K46 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp11Q99K46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp11Q99K46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms