Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd6Q99JI4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Psmd6Q99JI4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd6Q99JI4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms