Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pacsin3Q99JB8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pacsin3Q99JB8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pacsin3Q99JB8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms