Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Def8Q99J78 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Def8Q99J78 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms