Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn16Q925N4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn16Q925N4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn16Q925N4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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