Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csmd1Q923L3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csmd1Q923L3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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