Protein–RNA interactions for Protein: Q923J1

Trpm7, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm7Q923J1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm7Q923J1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm7Q923J1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm7Q923J1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms