Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b5Q923D4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b5Q923D4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b5Q923D4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms